Os clubes e representantes da Federação Paulista de Futebol se reuniram na sede da entidade para definir as diretrizes da Série A3 do Campeonato Paulista 2016. A reunião determinou a manutenção do formato para o próximo ano.
Com isso, os 20 clubes jogarão em turno único na primeira fase, classificando os oito primeiros colocados para a segunda fase. Os últimos seis serão rebaixados para a Segunda Divisão de 2017.
A segunda fase será composta por dois grupos de quatro times, com as equipes jogando em turno e returno e com os líderes conquistando o acesso e indo à decisão. A final segue disputada em dois jogos.
A regra de 28 atletas inscritos foi mantida. Os clubes terão até o dia 28 de janeiro para inscrever os jogadores para a rodada inicial e até 4 de março, antes da 11ª rodada para completar a lista de 28 inscritos. Durante o campeonato, os clubes poderão trocar atletas lesionados gravemente, e entre as fases há a possibilidade de até quatro inscritos.
